Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Atg9bQ6EBV9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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