Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scaf8Q6DID3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms