Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms