Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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