Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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