Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptbn2Q68FG2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms