Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms