Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2bQ64511 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms