Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PatjQ63ZW7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PatjQ63ZW7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms