Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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