Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms