Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms