Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sin3bQ62141 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sin3bQ62141 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms