Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EsrrbQ61539 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EsrrbQ61539 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms