Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln3Q61124 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln3Q61124 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cln3Q61124 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cln3Q61124 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln3Q61124 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln3Q61124 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln3Q61124 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln3Q61124 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln3Q61124 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cln3Q61124 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln3Q61124 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms