Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r1bQ60829 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r1bQ60829 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms