Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf3Q60765 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms