Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a3Q5XF89 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms