Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psme4Q5SSW2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms