Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim41Q5NCC3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms