Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mdh1bQ5F204 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Mdh1bQ5F204 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mdh1bQ5F204 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Mdh1bQ5F204 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mdh1bQ5F204 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mdh1bQ5F204 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mdh1bQ5F204 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mdh1bQ5F204 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mdh1bQ5F204 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mdh1bQ5F204 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms