Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx25Q3ZT31 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms