Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms