Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms