Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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