Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnpc3Q3UZ01 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms