Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Capn13Q3UW68 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Capn13Q3UW68 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Capn13Q3UW68 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Capn13Q3UW68 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Capn13Q3UW68 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn13Q3UW68 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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