Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm29609Q3UU56 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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