Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms