Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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D13Ertd608eQ3UPR8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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