Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem253Q3UNB8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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