Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms