Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx27Q3UHD6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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