Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms