Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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