Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tamm41Q3TUH1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms