Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nlrx1Q3TL44 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrx1Q3TL44 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms