Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdlim7Q3TJD7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms