Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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