Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms