Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms