Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms