Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1aQ2LKU9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms