Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm1123Q1RME4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms