Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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