Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptcd3Q14C51 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms