Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ptchd1Q14B62 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ptchd1Q14B62 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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