Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VgfQ0VGU4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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