Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms