Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms